反渗透膜系统的典型工艺包括过滤、软化、杀菌、防氧化四大类。

过滤类工艺：主要采用混凝砂滤工艺或超滤工艺，目的是降低原水的浊度指标与污染指数，确保进入反渗透系统的水质符合要求。

软化类工艺：通过树脂交换方法降低进水中的难溶盐相关离子浓度，或投放阻垢剂提高给/浓水的难溶盐饱和度限值，以防止难溶盐在膜系统给/浓水流道中的饱和析出。当原水硬度较高时，还可以在原水中加入石灰形成碳酸钙沉淀。

杀菌类工艺：在预处理工艺前端投放氧化性或非氧化性杀菌剂，甚至采用紫外线杀菌工艺，杀灭系统原水中的微生物、藻类、细菌，以防止膜系统的菌类污染。

防氧化工艺：针对从市政管网取用的系统原水中已存在的余氯，或杀菌工艺所投放的二氧化氯、次氯酸钠等氧化性杀菌剂，在预处理系统末端用活性炭或亚硫酸钠还原氧化剂，以保护反渗透系统不受氧化性伤害。

此外，对于地下水为水源的系统中所含的铁、锰物质，常采用锰砂、曝气及过滤工艺加以去除。反渗透膜的产水通量存在明显的温度特性，低温条件下保持通量所需的工作压力明显上升，产水能耗显著增加。因此，在系统原水温度较低且具有廉价热源的条件下，可在预处理系统末端进行热交换以提高反渗透系统进水温度1。